1988年1月，学校更名为青岛海洋大学（邓小平题写校名）。
1994年，学校实现了国家教委与山东省共建体制，获得重点支持，首批进入“211工程”序列。
1989年，外国语学院的整体迁入浮山校区，学校形成了两处办学的格局。
2001年2月，国家教育部、山东省人民政府、国家海洋局、青岛市人民政府签署协议，共同重点建设中国海洋大学。
2001年，成为国家“985工程”重点建设的高等学校。
中国海洋大学
2002年6月，由学校牵头，联合青岛大学、青岛科技大学、青岛建工学院（现青岛理工大学），组建国家级大学科技园。 10月，学校获准更名为中国海洋大学。
青岛海洋大学国标代码 ：10423
青岛海洋大学毕业证编号（电子注册号） 编号规则 : 98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。
青岛海洋大学毕业证编号 （电子注册号）示例 :10423 1 2008 06 006826
青岛海洋大学毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
本中心库存全国各地大中专院校的历年毕业证原版样本。存有历任校（院）长签名章样本。