新疆医科大学厚博学院于2003年5月6日在乌鲁木齐获准成立，2004年2月5日由国家教育部教发函〔2004〕13号文件确认，是由新疆医科大学举办的、充分依托大学优质教育资源和办学优势建设发展的独立学院。2012年12月6日，克拉玛依市委市政府与新疆医科大学共同签订了合作建设新疆医科大学厚博学院协议书。2015年9月新校区落成，学院正式搬迁至克拉玛依市。
学院以医学类专业为主，开设临床医学、口腔医学、麻醉学、药学、医学影像技术、医学检验技术、护理学、中西医临床医学、公共事业管理、信息管理与信息系统、卫生检验与检疫等11个专业。
2017年5月，克拉玛依市委市政府与新疆医科大学就双方进一步合作办好厚博学院进行了协商，之后克拉玛依市委市政府与新疆医科大学签订了《新疆医科大学与克拉玛依市人民政府共建厚博学院备忘录》，根据备忘录精神，新疆医科大学厚博学院拟更名为“新疆医科大学克拉玛依学院”，定位为医学类院校。
经教育部党组会议研究决定，同意新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院，学校标识码为4165013560；同时撤销新疆医科大学厚博学院的建制。
新疆医科大学是一所集医疗、卫生、药学教学和科研为一体的综合性医科大学，内设17所学院（中医学院、基础医学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、第四临床医学院、第五临床医学院、第六临床医学院、成人教育学院、厚博学院、公共卫生学院、药学院、成教学院、护理学院、医学工程技术学院、国际医学教育学院、研究生院、语言学院），2个部（人文社会科学部、体育教学部），4个系（中医系、口腔系、针灸骨伤系、中药系），5所附属医疗机构。大学本部现有1个七年制临床医学专业，17个本科专业和专业方向，28个专科专业和专业方向；拥有临床医学、药学、环境卫生等一级学科博士后流动站3个，博士学位点3个，二级学科硕士学位点35个 , 一级学科专业硕士学位点2个；设有8个自治区级研究所（中心），5个自治区级重点学科，2个自治区级重点实验室，在全疆各地建有各类临床教学实习基地40余所。同时是全国48所高校“在职人员申请研究生学位授权单位”、全国45所高校“临床医学专业试点学位单位”和全国公共卫生管理专业硕士（MPH ）授予单位之一，拥有硕士生导师、博士生导师审批权、教师系列副教授、卫生系列主 任 医师专业技术职务评审权。 大学本部占地面积2696亩，建筑面积70万平方米。大学本部现有教职工6225人，专业技术人员4617人，具有高级专业技术职务人员947人。现有博士生导师35名，硕士生导师335名。全校有43名专家享受国家政府特殊津贴，13位同志获自治区有突出贡献的优秀专家称号。 大学本部同美、英、法、日、俄、巴基斯坦、哈萨克斯坦等17个国家以及国内20多所高等院校或科研机构建立了合作关系。图书馆拥有馆舍5452平方米 ，藏书40余万册。
新疆医科大学厚博学院国标代码 ：13560
新疆医科大学厚博学院毕业证编号（电子注册号） 编号规则 : 98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。
新疆医科大学厚博学院毕业证编号 （电子注册号）示例 :13560 1 2008 06 006826
新疆医科大学厚博学院毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
本中心库存全国各地大中专院校的历年毕业证原版样本。存有历任校（院）长签名章样本。